海关监管手续费是指海关对进口的减免税和保税货物实施监管、管理所提供服务而收取的手续费。企业在进口减免税和保税货物（如：减税或免税的机器设备，进料加工和来料加工项目内的，以及境外客商提供的，准于暂时免税进口的在国内加工、装配后复出口的进口原料、零件等）时，要注意交纳海关监管手续费。
 
   一、手续费的征收
 
   根据《中华人民共和国海关对进口减税、免税和保税货物征收海关监管手续费的办法》（1988年9月20日海关总署令第1号）有关规定，手续费按照以下标准征收：
 
（一）进口免税和保税货物，按照海关审定的货物的到岸价格的千分之三计征；
 
（二）进口减税货物，按照实际减除税负部分的货物的到岸价格的千分之三计征：
 
（三）对于进口后保税储存三十天（含三十天）以上未经加工即转运复出口的货物，按货物到岸价格的四分之一计征。
 
   手续费以人民币计征。进口减免税和保税货物的到岸价格如以外币计价的，要折合成人民币后计征。
 
   企业应当自海关签发手续费缴纳证次日起第七天内向海关缴纳手续费。逾期不缴的，除依法追缴外，由海关自到期之日至缴清手续费之日止，按日征收手续费总额的千分之一的滞纳金。企业有关人员应按照规定日期交纳手续费，以免要交纳滞纳金。
 
    二、免征手续费的条件
 
企业符合以下条件，可以免交手续费：
 
1、对于中外合资经营企业、中外合作经营企业、外商独资企业按照法律规定在投资额度内准予免税进口的机器设备、建厂（场）和安装、加固机器设备所需材料以及其他货物，暂免征收手续费。
 
2、进口下列减免税和保税货物，免征手续费：
 
（一）《中华人民共和国海关进出口税则》列名进口免税的货物；
 
（二）外国政府、国际组织无偿赠送的物资；
 
（三）外国团体和个人赠送的礼品及华侨、港澳台同胞捐赠的用于公益事业的物资；
 
（四）用于救灾的物资；
 
（五）进口供残疾人专用的设备和物品，以及残疾人福利工厂进口的机器设备；
 
（六）享受外交特权和豁免的外国机构进口的公务用品；
 
（七）在海关放行前遭受损坏或者损失而准予减免税的进口货物；
 
（八）向国外索赔的准予减免税的进口货物；
 
（九）进口后未经加工，保税储存不足三十天即转运复出口的货物；
 
（十）收取手续费在人民币十元以下的减免税货物；
 
（十一）经国务院及海关总署特准免征手续费的其他减免税和保税货物。
 
   另外，要注意的是，企业在交纳海关监管手续费后，如果并未实际进口全部料件，可以在合同核销之前向海关申请将未实际进口部分料件的监管手续费退还。
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